SUMO(small ubiquitin-like modifier)化修饰是一种可逆的蛋白翻译后修饰,与泛素化修饰类似。泛素化修饰主要使靶蛋白被蛋白酶体识别和降解,而SUMO化修饰往往通过竞争结合泛素化修饰位点增加蛋白的稳定性。SUMO化修饰参与调节蛋白-蛋白、蛋白-DNA的相互作用,从而介导靶蛋白的定位和功能调控。因此,SUMO化修饰通过对靶蛋白功能的复杂调节,参与了转录调控、细胞周期调控、免疫应答等多种生物学过程。
背景说明
SUMO(small ubiquitin-like modifier)化修饰是一种可逆的蛋白翻译后修饰,与泛素化修饰类似。泛素化修饰主要使靶蛋白被蛋白酶体识别和降解,而SUMO化修饰往往通过竞争结合泛素化修饰位点增加蛋白的稳定性。SUMO化修饰参与调节蛋白-蛋白、蛋白-DNA的相互作用,从而介导靶蛋白的定位和功能调控。因此,SUMO化修饰通过对靶蛋白功能的复杂调节,参与了转录调控、细胞周期调控、免疫应答等多种生物学过程。
SUMO化修饰生物学过程:首先SUMO化由SUMO活化酶复合物E1以ATP依赖的方式形成硫酯键;接着具有活性的SUMO与SUMO结合酶E2结合,再次形成硫酯键;最后在连接酶E3的作用下,SUMO复合体与底物蛋白的赖氨酸残基结合,从而完成底物蛋白的SUMO化修饰。此外,底物蛋白也可以在连接酶E4的作用下被多个SUMO化修饰。
图 SUMO化修饰组学检测流程
SUMO修饰的功能
蛋白质定位:SUMO修饰可以调节蛋白质的亚细胞定位,如促进蛋白质进入或退出细胞核。
蛋白质稳定性:SUMO修饰可以保护蛋白质免受降解,从而增强蛋白质的稳定性。
蛋白质相互作用:SUMO修饰可以调节蛋白质之间的相互作用,影响蛋白质复合物的形成和功能。
基因表达调控:SUMO修饰可以影响转录因子的活性,从而调控基因的表达。
SUMO修饰的生物学作用
细胞周期调控:SUMO修饰参与细胞周期的调控,通过修饰关键的细胞周期蛋白来影响细胞周期的进程。
应激反应:在细胞受到应激(如DNA损伤、氧化应激等)时,SUMO修饰可以调节相关蛋白质的功能,帮助细胞应对应激。
神经退行性疾病:SUMO修饰的异常与多种神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病等)的发生发展有关。
癌症:SUMO修饰在癌症的发生和发展中也起着重要作用,其异常调控可能促进肿瘤的生长和转移。
图 SUMO化修饰生物学过程(Roy et al.,2021)
服务流程
蛋白提取——蛋白酶切——SUMO化肽段富集——质谱上机分析——质谱原始数据分析——定性分析——生物信息学分析
服务内容及说明
我司优势
1、使用先进的Orbitrap Astral质谱仪,提供高灵敏度、高通量的分析,为获得高质量的数据保驾护航;
2、具有专业的修饰蛋白质组学分析团队,可提供个性化服务;
3、结合我司其他业务提供全套的解决方案。
实验周期
可致电详询(400-027-0273)
客户下单及项目信息填写
在我司官网http://plant.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息,包括:
1、样品来源、含量、状态、个数及其他基本信息;
2、尽可能丰富的相关资料、文献。
实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告、检测结果可在线查看或打印,并永久保留。
实验交付内容
1、提供完整的结题报告;
2、输出结构.pdf文件(输出结果的结构展示);
3、蛋白鉴定、定量信息,以及基于蛋白定量信息的差异蛋白筛选、火山图、PCA图和聚类分析等基础分析结果;
4、当每组生物重复3个以上,至少2组时,提供各比较组差异蛋白的GO、KEGG、COG注释与富集分析结果,以及基于STRING数据库的蛋白互作网络分析结果。